Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnnt2P50752 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt2P50752 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms