Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TspoP50637 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TspoP50637 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TspoP50637 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TspoP50637 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TspoP50637 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TspoP50637 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TspoP50637 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TspoP50637 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TspoP50637 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TspoP50637 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TspoP50637 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TspoP50637 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TspoP50637 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms