Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FmodP50608 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FmodP50608 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FmodP50608 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FmodP50608 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FmodP50608 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FmodP50608 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FmodP50608 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FmodP50608 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FmodP50608 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FmodP50608 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FmodP50608 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FmodP50608 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FmodP50608 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FmodP50608 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FmodP50608 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FmodP50608 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FmodP50608 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FmodP50608 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FmodP50608 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FmodP50608 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FmodP50608 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FmodP50608 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FmodP50608 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FmodP50608 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms