Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl5P50228 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cxcl5P50228 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl5P50228 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms