Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn1cP49919 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkn1cP49919 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn1cP49919 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms