Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfbP49766 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfbP49766 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfbP49766 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfbP49766 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfbP49766 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VegfbP49766 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfbP49766 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfbP49766 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms