Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HpdP49429 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HpdP49429 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HpdP49429 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpdP49429 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HpdP49429 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpdP49429 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpdP49429 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HpdP49429 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpdP49429 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpdP49429 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HpdP49429 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HpdP49429 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HpdP49429 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HpdP49429 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpdP49429 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpdP49429 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpdP49429 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpdP49429 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpdP49429 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpdP49429 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpdP49429 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HpdP49429 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpdP49429 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpdP49429 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpdP49429 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpdP49429 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpdP49429 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HpdP49429 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HpdP49429 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HpdP49429 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HpdP49429 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HpdP49429 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HpdP49429 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HpdP49429 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HpdP49429 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HpdP49429 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HpdP49429 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HpdP49429 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HpdP49429 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HpdP49429 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HpdP49429 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HpdP49429 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HpdP49429 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HpdP49429 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HpdP49429 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HpdP49429 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HpdP49429 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HpdP49429 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HpdP49429 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HpdP49429 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms