Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbp3P49194 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbp3P49194 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbp3P49194 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms