Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc3P49135 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc3P49135 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc3P49135 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms