Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnni3P48787 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnni3P48787 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnni3P48787 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms