Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcd1P48410 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcd1P48410 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcd1P48410 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms