Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx2P48379 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx2P48379 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfx2P48379 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms