Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rpl13P47963 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl13P47963 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms