Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PfkmP47857 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PfkmP47857 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PfkmP47857 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PfkmP47857 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PfkmP47857 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfkmP47857 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PfkmP47857 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfkmP47857 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms