Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11bP46638 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11bP46638 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms