Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ItgavP43406 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItgavP43406 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItgavP43406 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgavP43406 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms