Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HttP42859 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HttP42859 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HttP42859 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HttP42859 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HttP42859 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HttP42859 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HttP42859 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HttP42859 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HttP42859 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HttP42859 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HttP42859 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HttP42859 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HttP42859 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HttP42859 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HttP42859 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HttP42859 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HttP42859 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HttP42859 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HttP42859 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HttP42859 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HttP42859 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HttP42859 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HttP42859 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HttP42859 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HttP42859 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HttP42859 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HttP42859 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HttP42859 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HttP42859 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HttP42859 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HttP42859 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HttP42859 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HttP42859 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HttP42859 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HttP42859 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HttP42859 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HttP42859 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HttP42859 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HttP42859 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HttP42859 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HttP42859 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HttP42859 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HttP42859 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HttP42859 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HttP42859 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HttP42859 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HttP42859 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HttP42859 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HttP42859 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HttP42859 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HttP42859 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HttP42859 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HttP42859 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HttP42859 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HttP42859 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HttP42859 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HttP42859 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HttP42859 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HttP42859 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HttP42859 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HttP42859 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HttP42859 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HttP42859 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HttP42859 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HttP42859 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HttP42859 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HttP42859 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HttP42859 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HttP42859 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HttP42859 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HttP42859 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HttP42859 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms