Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx1-2P42580 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx1-2P42580 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx1-2P42580 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms