Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tac1P41539 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac1P41539 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tac1P41539 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tac1P41539 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tac1P41539 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tac1P41539 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms