Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv1P41164 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv1P41164 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Etv1P41164 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Etv1P41164 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Etv1P41164 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Etv1P41164 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms