Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VhlP40338 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VhlP40338 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VhlP40338 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VhlP40338 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VhlP40338 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VhlP40338 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VhlP40338 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VhlP40338 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VhlP40338 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VhlP40338 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VhlP40338 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VhlP40338 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VhlP40338 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VhlP40338 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VhlP40338 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VhlP40338 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VhlP40338 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VhlP40338 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VhlP40338 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VhlP40338 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VhlP40338 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VhlP40338 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VhlP40338 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VhlP40338 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VhlP40338 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms