Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lig1P37913 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig1P37913 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig1P37913 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lig1P37913 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig1P37913 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig1P37913 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig1P37913 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig1P37913 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms