Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1aP36536 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sar1aP36536 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms