Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab20P35295 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab20P35295 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab20P35295 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab20P35295 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab20P35295 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab20P35295 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab20P35295 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab20P35295 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab20P35295 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rab20P35295 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab20P35295 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab20P35295 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab20P35295 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab20P35295 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab20P35295 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms