Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn11P35235 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn11P35235 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn11P35235 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms