Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stfa3P35173 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stfa3P35173 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stfa3P35173 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms