Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tfap2aP34056 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2aP34056 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms