Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnar1P33896 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnar1P33896 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnar1P33896 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms