Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoc3P33622 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoc3P33622 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoc3P33622 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms