Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc5P32043 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc5P32043 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms