Protein–RNA interactions for Protein: P31955

Areg, Amphiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AregP31955 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AregP31955 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AregP31955 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AregP31955 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AregP31955 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AregP31955 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AregP31955 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AregP31955 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AregP31955 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AregP31955 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AregP31955 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AregP31955 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AregP31955 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AregP31955 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AregP31955 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AregP31955 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AregP31955 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AregP31955 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AregP31955 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AregP31955 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AregP31955 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AregP31955 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AregP31955 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AregP31955 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AregP31955 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AregP31955 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AregP31955 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AregP31955 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AregP31955 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AregP31955 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AregP31955 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AregP31955 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AregP31955 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AregP31955 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AregP31955 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AregP31955 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AregP31955 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AregP31955 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AregP31955 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AregP31955 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AregP31955 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AregP31955 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AregP31955 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AregP31955 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AregP31955 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AregP31955 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AregP31955 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AregP31955 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AregP31955 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AregP31955 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AregP31955 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AregP31955 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AregP31955 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AregP31955 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AregP31955 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AregP31955 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AregP31955 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AregP31955 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AregP31955 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms