Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Saa4P31532 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Saa4P31532 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Saa4P31532 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms