Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxa11P31311 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxa11P31311 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxa11P31311 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms