Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa2P31245 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms