Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd28P31041 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd28P31041 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd28P31041 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms