Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx2P30658 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx2P30658 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms