Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VtnP29788 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VtnP29788 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VtnP29788 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VtnP29788 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VtnP29788 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VtnP29788 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VtnP29788 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VtnP29788 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VtnP29788 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VtnP29788 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VtnP29788 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VtnP29788 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VtnP29788 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VtnP29788 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VtnP29788 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VtnP29788 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VtnP29788 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VtnP29788 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VtnP29788 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VtnP29788 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VtnP29788 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VtnP29788 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VtnP29788 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VtnP29788 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VtnP29788 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VtnP29788 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VtnP29788 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VtnP29788 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VtnP29788 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VtnP29788 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VtnP29788 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VtnP29788 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VtnP29788 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VtnP29788 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VtnP29788 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VtnP29788 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VtnP29788 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VtnP29788 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VtnP29788 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VtnP29788 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms