Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp2P29594 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp2P29594 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Casp2P29594 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp2P29594 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms