Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vcam1P29533 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vcam1P29533 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vcam1P29533 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms