Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TbpP29037 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TbpP29037 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TbpP29037 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TbpP29037 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TbpP29037 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TbpP29037 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TbpP29037 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TbpP29037 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TbpP29037 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TbpP29037 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TbpP29037 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TbpP29037 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TbpP29037 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TbpP29037 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TbpP29037 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TbpP29037 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TbpP29037 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TbpP29037 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TbpP29037 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TbpP29037 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TbpP29037 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms