Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprmP28828 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprmP28828 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprmP28828 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprmP28828 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprmP28828 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprmP28828 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprmP28828 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprmP28828 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprmP28828 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprmP28828 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PtprmP28828 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprmP28828 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprmP28828 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprmP28828 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprmP28828 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PtprmP28828 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprmP28828 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
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