Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Marcksl1P28667 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms