Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NapbP28663 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NapbP28663 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NapbP28663 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NapbP28663 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NapbP28663 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NapbP28663 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NapbP28663 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NapbP28663 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NapbP28663 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NapbP28663 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NapbP28663 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NapbP28663 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NapbP28663 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NapbP28663 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NapbP28663 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NapbP28663 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NapbP28663 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NapbP28663 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NapbP28663 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NapbP28663 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NapbP28663 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NapbP28663 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NapbP28663 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NapbP28663 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NapbP28663 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NapbP28663 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NapbP28663 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NapbP28663 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NapbP28663 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NapbP28663 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NapbP28663 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NapbP28663 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NapbP28663 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NapbP28663 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NapbP28663 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NapbP28663 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NapbP28663 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NapbP28663 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NapbP28663 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NapbP28663 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NapbP28663 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NapbP28663 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NapbP28663 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NapbP28663 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NapbP28663 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NapbP28663 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NapbP28663 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NapbP28663 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NapbP28663 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NapbP28663 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NapbP28663 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NapbP28663 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NapbP28663 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms