Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dusp1P28563 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dusp1P28563 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms