Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Aco1P28271 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aco1P28271 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aco1P28271 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aco1P28271 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aco1P28271 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aco1P28271 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aco1P28271 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aco1P28271 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aco1P28271 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aco1P28271 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Aco1P28271 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aco1P28271 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms