Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb1P28230 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb1P28230 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms