Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gjc1P28229 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gjc1P28229 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms