Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lef1P27782 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lef1P27782 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lef1P27782 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms