Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Twist1P26687 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Twist1P26687 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Twist1P26687 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Twist1P26687 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms