Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfraP26618 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfraP26618 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfraP26618 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfraP26618 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfraP26618 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfraP26618 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfraP26618 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfraP26618 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfraP26618 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfraP26618 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfraP26618 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfraP26618 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfraP26618 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfraP26618 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PdgfraP26618 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfraP26618 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfraP26618 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfraP26618 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PdgfraP26618 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfraP26618 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfraP26618 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfraP26618 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfraP26618 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfraP26618 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PdgfraP26618 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PdgfraP26618 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfraP26618 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfraP26618 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfraP26618 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfraP26618 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfraP26618 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfraP26618 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfraP26618 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PdgfraP26618 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms